קיים קשר מורכב בין קנאביס להפרעה דו קוטבית. יש מדענים המאמינים שלקנאביס יש פוטנציאל להחמיר את ההפרעה. עם זאת, אחרים טוענים שהוא יכול לעזור. הסובלים מהפרעה דו קוטבית חווים מצבי רוח קיצוניים במצב של "רכבת הרים" רגשית. שינויים אלו במצב הרוח יכולים להשפיע על השינה, האנרגיה, הפעילות, השיפוט, ההתנהגות והיכולת לחשוב בבהירות.
בעוד שדרוש מחקר נוסף על הקשר בין קנאביס להפרעה דו קוטבית, ישנם מטופלים הטוענים כי חוו הקלה בזכות הקנאביס. לפי מטופלים אלה הקנאביס מקל על תסמינים כמו דיכאון ומאניה. ניתן לעיין ברשימת זני הקנאביס בעמוד זה כדי למצוא את המתאימים ביותר לסובלים מהפרעה דו קוטבית.